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熒光定量PCR結(jié)果分析解讀—熒光定量PCR外包

2022-07-26 11:17:27

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺

        大家好,今天普拉特澤生物跟大家一起學習的是熒光定量PCR實驗結(jié)果的分析與解讀,上期我們學習了熒光定量PCR實驗的操作步驟,不記得的可以點擊回去復習哦。普拉特澤生物表達檢測平臺專業(yè)承接熒光定量PCR實驗外包與代做服務,本文我們就來一點一點看,熒光定量PCR結(jié)果到底應該如何分析與解讀。

        1基線

        基線是指實時PCR反應的基線是指在PCR的初始循環(huán)期間的信號水平,通常是315的循環(huán)之間,此時熒光信號幾乎沒有變化。此時低信號可以認為是背景或反應的噪音?;€應該設置應考慮,在消除早期擴增循環(huán)中背景的同時,不覆蓋掉明顯非背景的擴增信號。當比較不同的qPCR反應或?qū)嶒灂r,應定義同一基線。

        2、閾值

        qPCR的閾值代表的是明顯超出基線的擴增信號水平,用以區(qū)分明確的擴增信號和背景。通常,qPCR儀器自帶軟件會自動將閾值設置為基線熒光值標準偏差的10倍。

        3、CT

        Ct是指熒光信號超過閾值時對應的循環(huán)數(shù)。Ct值與目的基因的起始量成反比,可用于計算DNA初始拷貝數(shù)。隨著模板量減少,檢測到顯著擴增時的循環(huán)數(shù)會增加。

        4、擴增曲線

        擴增曲線 早期循環(huán)中,熒光信號幾乎沒有變化。隨著反應的進行,每個循環(huán)的熒光水平開始顯著上升,被稱為指數(shù)期。一般在在指數(shù)期的早期階段而不是后期的平臺期進行定量分析。在指數(shù)階段開始時,所有的試劑仍然是過量的,DNA聚合酶仍然高效,并且擴增產(chǎn)物量還較低,不會在退火時與引物競爭。這些因素都有助于更準確的定量。

        5、溶解曲線

        熔解曲線 熔解曲線描繪了隨著反應溫度升高,摻入染料分子的dsDNA解離成單鏈DNAssDNA)時的熒光變化。例如,當結(jié)合SYBR? Green I染料的dsDNA被加熱時,達到解鏈溫度(Tm)后,由于雙聯(lián)DNA鏈解離而釋放出染料,熒光信號會急劇降低。以熒光信號隨時間變化作圖可得到圖3A,然后以ΔF/ΔT(熒光變化/溫度變化)值與溫度作圖,可得到熔融動力學的清晰視圖(圖3B)??梢愿鶕?jù)熔解曲線來判斷qPCR反應的特異性,特異性的擴增的溶解曲線會是一個緊密的單峰。

        6、相對定量

        相對定量,不像絕對量化嚴格,應用于大多數(shù)基因表達水研究。相對定量關注的并非某個基因的絕對表達量,而是同一基因在樣本間的表達差異(如實驗組和對照組)。結(jié)果以處理組相對于未處理組的表達差異倍數(shù)表示。這種分析方法不需要測定精確的拷貝數(shù),重點是在與未處理樣品組相比的表達變化上。

        相對定量算法—ΔΔCt ΔΔCt方法是比較組別間同一基因表達差異的常用方法。通過將目的基因Ct(Ct 目的)與自身內(nèi)參Ct值(Ct 內(nèi)參)進行比較,可得到每一組別的ΔCt,再將實驗組與對照組進行計算得到ΔΔCt。ΔΔCt的大小關聯(lián)目的基因表達水平的倍數(shù)差異大小。

        倍數(shù)差異 = 2–ΔΔCt

        ΔCt 實驗組 – ΔCt 對照組 = ΔΔCt

        Ct 目的 實– Ct 內(nèi)參 實 = ΔCt 實驗組

        Ct 目的 對– Ct 內(nèi)參 對照 = ΔCt 對照組

        好啦,實驗結(jié)果的數(shù)據(jù)應該怎么分析以及數(shù)據(jù)的意義咱們就講到這里啦,如果您還有更多的問題,歡迎您留言跟咱們的技術一起留言討論,如果您需要熒光定量PCR實驗代做與外包的服務,請一定記得您生物科研路上的好盟友——普拉特澤!

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