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很多人WB結(jié)果不好,卻沒懷疑過自己的膠選錯了

2025-10-28 11:55:23

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺

Question:很多人WB結(jié)果不好,卻沒懷疑過自己的膠選錯了(普拉特澤生物提供長期穩(wěn)定的wb實驗外包服務)

一、凝膠濃度對蛋白有哪些影響呢?




把聚丙烯酰胺凝膠想象成一個分子篩網(wǎng):


1)高濃度膠(如15%):網(wǎng)眼小,小蛋白能靈活穿梭,大蛋白則寸步難行

2)低濃度膠(如8%):網(wǎng)眼大,大蛋白可以自由奔馳,小蛋白卻可能“剎不住車”


選錯濃度會怎樣?


1)膠太濃:大蛋白分離不開,擠成一團

2)膠太稀:小蛋白跑得太快,直接“跑丟”



二、到底應該怎么選擇濃度膠呢?


濃度膠選擇技巧:



1)不確定時選10%:適合大多數(shù)常見蛋白(這也是我們常用的濃度膠


2)大蛋白用低濃度:更容易分離且轉(zhuǎn)膜更充分

3)梯度膠是神器:從上到下濃度遞增,一塊膠搞定不同大小蛋白



特殊分離膠濃度需要考量:


1)應對超大或超小分子量蛋白


對于大于200 kDa的蛋白,比如200 kDa或280 kDa的蛋白,推薦使用6%或7% 的分離膠,并適當延長電泳時間


對于小于20 kDa的小分子蛋白或多肽,常規(guī)的Tris-甘氨酸系統(tǒng)分離效果可能不佳。這時,Tris-Tricine緩沖系統(tǒng)的預制膠(例如16.5% 的濃度)是更好的選擇,它能更有效地分離2-40 kDa的小分子量蛋白。


2)使用梯度膠應對寬范圍或不同大小的蛋白
如果需要分離的蛋白分子量分布很廣,或者想在同一塊膠上同時分析多個不同大小的蛋白,梯度膠(例如4-12% , 4-20% )會非常方便。它從膠頂?shù)侥z底的濃度是連續(xù)變化的,因此可以在同一塊膠上清晰地分離出分子量差異很大的蛋白。


三、經(jīng)驗


由于我的研究課題涉及到的蛋白分子量在15-150kd范圍內(nèi),所以我常用的就是雅酶10%的一步法預混膠,下面給大家看看電泳的效果吧

??這是剛開始跑的時候


?? 這是快要結(jié)束的時候

、

四、我們WB時需要關(guān)注濃度膠的那些情況呢?

1.根據(jù)自己的目標分子選擇對應的濃度膠,保證蛋白電泳過程中順利下沉及分開,不懂時可以咨詢一下師兄師姐,特別是與他人蛋白kd數(shù)差距甚遠時。 

 2.配膠時一定要注意添加手法,學姐一直推薦左右滑動著加上下層膠,因為在玻璃板的一角加入,容易導致配膠濃度不均,即使添加前已吹打混勻,添加完畢+插完梳子以后,將制膠架于實驗桌上輕磕一下,保證分界線平齊。 

 3.配膠后凝固時間適當,學姐真的不建議提前配膠,盡量現(xiàn)配現(xiàn)用,學姐之前在北方,夏天冬天溫差不是特別大(因為北方有暖氣),所以我夏天和冬天的凝膠時間都是固定的。但是學姐現(xiàn)在到南方了,冬天的時候氣溫低,凝膠時間就需要延長20-30min,或者多添加一些促凝劑,以便縮短凝膠時間。 

判斷濃度膠凝固知識點:插梳子以后,玻璃板會多出一部分上層膠流在制膠架上,我們可以等待20-30min以后,將玻璃板拆卸下來,看看多余的膠是否凝好,若是呈膠條狀,則代表膠已凝好,可以電泳。

4.注意緩沖液系統(tǒng),分離小分子量蛋白(<20 kDa)時,記得Tris-Tricine系統(tǒng)比常規(guī)的Tris-甘氨酸系統(tǒng)效果更好。 

  5.預制膠是很多同學的優(yōu)先選擇,因為可以節(jié)省配膠時間,但是一定要注意預制膠的保存以及使用方法,否則可能會讓你浪費更多的時間去試錯。對于大分子量蛋白,有建議使用6%的分離膠,而小分子量蛋白則可選用16.5%的Tricine預制膠,常規(guī)分子量推薦10%的預制膠。

文源【醫(yī)學盛夏學姐】

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