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支原體檢測

支原體是細(xì)胞外生存的最小微生物,是一類缺乏細(xì)胞壁的原核細(xì)胞型微生物,呈高度多形性,有球形、桿形、絲狀、分枝狀等多種形態(tài)。通過對支原體特定的序列設(shè)計(jì)引物,當(dāng)存在支原體污染時(shí)通過PCR特異性擴(kuò)增,會(huì)將目標(biāo)DNA特異性地復(fù)制,然后通過瓊脂糖電泳檢測,會(huì)跑出條帶出現(xiàn)陽性結(jié)果。反之當(dāng)沒有支原體污染時(shí),由于沒有模板,PCR無法擴(kuò)增,則瓊脂糖電泳跑不出條帶,出現(xiàn)陰性結(jié)果。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【實(shí)驗(yàn)原理】

原核生物的rRNA堿基序列非常保守,而rRNA操縱子上編碼rRNA的DNA間隔區(qū)如16S和23S間隔區(qū),各種生物種間的堿基序列差別很大。這個(gè)間隔區(qū)的 DNA序列及長度在 Mycoplasma 各個(gè)種間既有相對保守的部分,也有具有很大差異的部分。本制品是在編碼 16S 和 23S rRNA 的 DNA 上設(shè)計(jì)一對 F1/R1 引物,擴(kuò)增編碼 16S 和 23S rRNA 的 DNA 間隔區(qū)。此反應(yīng)體系只特異性擴(kuò)增 Mycoplasma DNA,檢出靈敏度與特異性都很高。

通過對支原體特定的序列設(shè)計(jì)引物,當(dāng)存在支原體污染時(shí)通過PCR特異性擴(kuò)增,會(huì)將目標(biāo)DNA特異性地復(fù)制,然后通過瓊脂糖電泳檢測,會(huì)跑出條帶出現(xiàn)陽性結(jié)果。反之當(dāng)沒有支原體污染時(shí),由于沒有模板,PCR無法擴(kuò)增,則瓊脂糖電泳跑不出條帶,出現(xiàn)陰性結(jié)果。


【實(shí)驗(yàn)流程】

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案例展示


 支原體檢測_副本.png

3個(gè)樣本的支原體檢測,分別設(shè)置陽性對照Pc: Positive  control,陰性對照Nc: Negative control,待測樣本1, 2, 3。

常見問題

1、取待檢樣本:

一般是接種后進(jìn)行 3-6d細(xì)胞培養(yǎng)的培養(yǎng)上清液;

如果使用 Eagle 等常用的細(xì)胞培養(yǎng)基時(shí),培養(yǎng)上清可直接加入到 PCR 反應(yīng)液中;

如果使用細(xì)胞懸濁液作為樣品,則需要提取 DNA,再進(jìn)行 PCR 反應(yīng)。    

2、一定要設(shè)置陽性對照(一般采用帶有支原體特異片段的質(zhì)粒)與陰性對照(H2O);

3、配制PCR反應(yīng)體系時(shí)需在超凈工作臺(tái)里進(jìn)行,避免污染。

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動(dòng)物組織單個(gè)樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個(gè)樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個(gè)基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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